聚甲酚磺醛溶液的不良反应有：聚甲酚磺醛溶液有时出现局部刺激症状，如烧灼感或疼痛。聚甲酚磺醛溶液为高酸性物质治疗口腔病变时可能损伤牙釉质。有最大程度上避免聚甲酚磺醛溶液的不良反应，我们首先要注意一下其注意事项。
聚甲酚磺醛是由亚甲基连接的m-甲酚磺酸聚合物，其链长短不一。值得注意的注意事项有：
1、聚甲酚磺醛溶液为外用药切忌内服
2、本品应避免与眼睛接触
3、本品会加速和增强修复过程如果用药后出现坏死组织从病灶处脱落有时甚至是大片脱落无需惊恐
4、经期停止治疗治疗期间避免性生活不要使用刺激性肥皂清洗患处
5、棉织物及皮革与该药液接触后须在制剂未干前立即用水洗净
6、所有治疗用具使用后均应在水中浸泡(必要时加入%～%的氢氧化钠)
7、出现不良反应较严重时应停药