关联关系表填写方法如下：
1、关联关系表中企业所得税申报表及附表与关联业务往来报告表分开保存，但在其填写结束并进行数据保存时若给出提示企业若存在与关联方业务往来、境外投资或对外支付款项等事项的，按照税法规定填写报关联交易报告表；
2、在关联关系表中的所得税年度申报表及附表模块转入关联业务往来报告表模块填写时，增加提示对话框并通过提供标签页方式填报关联业务往来报告表；
3、所有关联关系表的填写需满足录入、修改、保存、多格式输出、打印、填报说明查询等功能；
4、系统需在给出所得税年度申报申报成功信息提示或申报开票扣款前，对关联关系表中申报表的完整性进行数据检验，按照关联关系表的参数规定修改填写值。